2003年，智利鮭魚出口增長率開始翻倍。2003年增長18%。2004年增長25%，總價值20億美元。2005年和2006年分別增長20%和28%。

    智利四大鮭魚公司的報告顯示，2007年前8個月智利鮭魚總體出口下滑。世界最大的鮭魚公司，挪威MarineHarvest公司下降43.%。其他三家公司，PesqueraChamachaca下落10.9%，SalmonesAntartica減少4.4%，Ventisqueros減少2.3%。

    出口數據下滑，加上上市公司鮭魚股價呈下降趨勢，令投資者一度擔憂。MarineHarvest第三季度不盡人意的盈利導致股價震蕩下跌20%。智利第三大鮭魚出口商Multiexport則遭受了14%的滑跌。PesqueraMardeChiloe也無可避免的損失12%。

    除了出口數據下滑外，智利科學界的研究結果讓智利鮭魚產業更加難于應付。科學家們的研究顯示，智利鮭魚領域存在接觸傳染性鮭魚貧血病毒（InfectiousSalmonAnemiavirus）。該病毒可導致該珍貴魚種死亡，但對人類沒有影響。

    智利鮭魚產業的其他問題有：消極的環境影響，水產養殖場主的勞工違法，性別歧視和土著人權利等。