中國水產門戶網報道雖然淡水小龍蝦對環境的適應力及耐低氧能力很強，甚至可以直接利用空氣中的氧，但長時間處于低氧和水質過肥或惡化的環境中會影響淡水小龍蝦的蛻殼速率，從而影響淡水小龍蝦的生長。因此，水質是限制淡水小龍蝦生長，影響養蝦產量的重要因素。淡水小龍蝦在不良的水質中攝食下降，甚至停止攝食，因而影響淡水小龍蝦的生長。不良的水質又可助長寄生蟲、細菌等有害生物的大量繁殖，導致疾病的發生和蔓延，水質嚴重不良時，還能造成死亡，致使養蝦的失敗。在高密度池塘養殖淡水小龍蝦時，透明度要控制在40cm左右，按照季節變化及水溫，水質狀況及時進行調整，適時加水，換水，施追肥，營造一個良好的水質環境。 
　　1、水位控制
　　淡水小龍蝦的養殖水位根據水溫的變化而定，掌握“春淺、夏滿”的原則。春季一般保持在0.6—1m之間，淺水有利于水草的生長、螺螄的繁育和幼蝦和蛻殼生長。夏季水溫較高時，水深控制在1—1.5米，有利于淡水小龍蝦過高溫季節。
　　2、適時換水
　　平時定期或不定期加注新水，原則是蛻殼高峰期不換水，雨后不換水，水質較差時多換水，一般每7天換水1次，高溫季節每2—3天換水1次，每次換水量為池水的20%—30%。使水質保持“肥、適、嫩、爽”有條件的還可以定期地向水體中潑灑一定量的光合細菌、硝化細菌之類的生物制劑調節水體。
　　3、調節pH值
　　每半月灑一次生石灰水，用量為1米水深時，每畝10kg,，使池水pH值保持在7.5—8.5之間，同時可增加水體鈣離子濃度，促進淡水小龍蝦蛻殼生長。
　　發現水質敗壞，且出現淡水小龍蝦上岸、攀爬、甚至死亡等現象，必須盡快采取措施，改善水環境。具體方法：
　　①先換部分老水，用二氯海因0.3×10﹣6對水體進行潑灑消毒后加注新水。
　　②第二天用沸石粉20×10﹣6、益水寶（枯草芽胞桿菌）0.4×10﹣6潑灑，
　　③以后每隔5d左右，定期向水體中潑灑微生態制劑。利用有意菌種制劑，使之形成優勢菌群來抑制致病微生物的種群數量、生長、繁殖和危害程度，并分解水中有害物，增加溶氧，改善水質。如施用光合細菌、硝化細菌、芽胞桿菌、酵母菌等，均能起到上述作用。