中國水產門戶網報道羅非魚抗病力較強，在養殖中一般不易患病，但由于管理等原因，也會發生一些常見病。另外，在羅非魚越冬期間，因水溫過低、密度過大和水質差等原因，也易患病。以下是一些常見病及防治方法：
（1）水霉病(膚霉病)我國常見的水霉病病原體有新株形異霉、反常異霉、同絲水霉、多子水霉、寄生水霉、尾細囊霉、兩性綿霉及腐霉等。菌體一般由內外兩種不同絲狀菌絲組成。
內菌絲分枝較細而多，生長在魚體肌肉之內，具有吸收養料的功能；外菌絲分枝少而粗壯，在魚體表肉眼可見的灰白色的絮狀物。在越冬期間容易發生。發病時，魚體表面像舊棉絮狀的菌絲伸入肌肉組織，它能分泌一種酵素分解魚的組織，使病魚組織壞死，同時魚體負擔過重，游動失常，食欲減退，最后瘦弱而死。防治方法是在拉網、運輸和放養過程中，操作盡量仔細，勿使魚體受傷。魚種發病時，可采用每畝（1米水深）用五倍子1.5~2.5千克磨碎煮汁帶渣全塘潑灑，或400毫克/升食鹽、小蘇打（1∶1）全塘潑灑。
（2）小瓜蟲病(白點病)由多子小瓜蟲侵入魚體皮膚、鰓部而引起。此病對個體小的尼羅羅非魚和魚種為害最大，往往大量寄生，引起大批死亡。小瓜蟲侵入魚的皮膚和鰓的上皮組織，以寄生的組織細胞作營養，引起魚體組織發炎，形成白色的囊泡。嚴重時病魚的體表、鰓部黏液增多，鰓絲成暗紅色，魚體消瘦，病魚游動緩慢，浮于水面，呼吸困難，陸續有死亡。在水溫20℃左右時，2～3天可遍及全池，大量死亡。防治方法為：①越冬前用生石灰徹底消毒越冬池，每立方米水體用0.2千克，化水后全池潑灑；②用1%～2%食鹽水浸洗病魚15～20分鐘。但小瓜蟲經藥浴后，只脫落，并未殺死，故藥浴后的水應棄去，否則將重復感染。
（3）車輪蟲病  病原體是車輪蟲屬和小車輪屬種類，對羅非魚苗種危害甚大。癥狀：病魚的頭部和口的周圍呈灰白色，體表和鰓部黏液增多，大量感染時，病魚食欲減退，呼吸困難，離群獨游，游動緩慢，如不及時治療，可造成大批死亡。用顯微鏡檢查，在病魚體表和鰓上可見到大量車輪蟲，像車輪狀滾動。防治方法為：①越冬時，用生石灰徹底消毒越冬池；②用硫酸銅和硫酸亞鐵合劑全池潑灑，每立方米水體用硫酸銅0.5克和硫酸亞鐵0.2克，可殺滅魚體表和鰓上的車輪蟲。此外，每畝（水深1米）用苦楝樹枝葉30千克煮水全池遍灑，也有較好的效果。
（4）三代蟲  在成魚、魚苗、魚種體上都可寄生，而對苗種危害很大。患有三代蟲的魚苗種，最初呈現極度不安，時而狂游于水中或急劇側游于水下，繼而食欲不振，游動遲緩，魚體瘦弱，終致死亡。防治方法為：用晶體敵百蟲(90％)0.2～0.3毫克/升全池潑灑。
（5）斜管蟲病  病原體是鯉斜管蟲。鯉斜管蟲寄生在皮膚和鰓上，對寄主的選擇并不嚴格，也不限于成魚或魚苗、魚種。斜管蟲大量侵襲皮膚和鰓時，表皮組織因受刺激而分泌大量黏液，同時組織被破壞，嚴重影響魚的呼吸機能，大量寄生時，會使魚苗和親魚死亡。用0.7毫克/升硫酸銅全池潑灑，或用0.5毫克/升硫酸銅和0.2毫克/升硫酸亞鐵全池潑灑。水溫較低(17℃)時，可適當增至0.8毫克/升硫酸銅和0.32毫克/升硫酸亞鐵。
（6）突眼病  0.5克/米3溴氯海因全池潑灑，連續2天，并結合換水。
（7）腸炎  大蒜素8克/千克飼料拌成藥餌投喂，每天2次，連續投喂3~4天。