1、藻類毒素：

　　養(yǎng)殖過程中，藻類死亡分解產(chǎn)生的毒素;或者有害藻類大量繁殖產(chǎn)生毒素等(如微囊藻等藍(lán)藻類、裸甲藻類、魚腥藻、膝溝藻等對養(yǎng)殖危害極大的藻類)，主要是神經(jīng)毒素和肝毒素。

　　神經(jīng)毒素使養(yǎng)殖動物神經(jīng)麻痹，導(dǎo)致反應(yīng)遲鈍、痙攣抽搐、呼吸系統(tǒng)麻痹、呼吸困難等，嚴(yán)重者死亡;肝毒素導(dǎo)致養(yǎng)殖動物肝中毒，引起肝胰臟腫大、萎縮、壞死等一系列生理障礙。

　　2、微生物毒素：

　　主要是病原毒細(xì)菌的內(nèi)毒素、外毒素和真菌毒素。如黃曲霉素、嘔吐毒素等。

　　3、有機(jī)物分解過程中的有毒有害中間產(chǎn)物和最終產(chǎn)物：如：氨氮、亞硝酸鹽、硫化氫、組胺、吲哚等。

　　4、養(yǎng)殖過程中藥物使用：

　　養(yǎng)殖過程中使用的消毒劑、殺蟲劑、抗菌藥、過量施肥或過量使用化肥等。所謂“是藥三分毒”，這些藥物在使用過程中對魚蝦產(chǎn)生毒副作用。在藥物使用后，本身有毒性殘留或者本身無毒但與水體的其他物質(zhì)反應(yīng)產(chǎn)生新的有毒物質(zhì)。

　　這些有毒物質(zhì)，導(dǎo)致養(yǎng)殖動物肝胰臟功能受損，引起慢性中毒，抵抗力下降，繼發(fā)感染各種病毒細(xì)菌，甚至死亡。

　　養(yǎng)殖過程中容易產(chǎn)生“有毒”危害物質(zhì)的有：

　　1)消毒劑：如含氯制劑、重金屬、染料等

　　2)殺蟲藥：有機(jī)磷農(nóng)藥、菊酯類等

　　3)抗菌藥：抗生素、磺胺等

　　5、環(huán)境污染：

　　農(nóng)業(yè)污水(農(nóng)藥、化肥等)、工業(yè)污水(重金屬、有機(jī)溶劑等)、生活污水、各種富營養(yǎng)化水質(zhì)、空氣污染導(dǎo)致酸雨等各種有毒有害物質(zhì)污染水源進(jìn)入養(yǎng)殖區(qū)域，作為養(yǎng)殖水源使用。

　　6、營養(yǎng)過剩：

　　養(yǎng)戶追求高營養(yǎng)飼料，導(dǎo)致養(yǎng)殖動物無法充分吸收飼料營養(yǎng)，導(dǎo)致營養(yǎng)過剩，造成水質(zhì)污染;同時，蛋白等營養(yǎng)過剩，增加動物排泄壓力，導(dǎo)致肝毒素、腸道毒素等累積。

　　7、酸性水質(zhì)或堿性水質(zhì)養(yǎng)殖動物的影響：

　　魚蝦養(yǎng)殖魚蝦適宜pH值在6.5—9.0，而最適宜的范圍為弱堿性，即pH值在7.0～8.5之間;pH值雖在安全范圍內(nèi)，但當(dāng)超出最適范圍時也會影響魚類的生命活動，從而影響到養(yǎng)殖的產(chǎn)量和效益;pH值超出一定范圍高限為9.5—10、低限為4～5會直接造成養(yǎng)殖水生生物的死亡。pH值還通過影響其它的環(huán)境因子而間接影響到魚類的生長。

　　8、其他

　　在養(yǎng)殖過程中，還有各種各樣的對養(yǎng)殖動物危害較大的因素(如：缺氧等);以及目前未能檢測到的未知危害因素。